Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms