Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms