Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E9PCH4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E9PCH4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PCH4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PCH4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PCH4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PCH4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PCH4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PCH4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PCH4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PCH4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PCH4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms