Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HACD1B0YJ81 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms