Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms