Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NL46 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NL46 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms