Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNX13Q9Y5W8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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