Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L4

TIMM13, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM13Q9Y5L4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM13Q9Y5L4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM13Q9Y5L4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM13Q9Y5L4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM13Q9Y5L4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM13Q9Y5L4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TIMM13Q9Y5L4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TIMM13Q9Y5L4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TIMM13Q9Y5L4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TIMM13Q9Y5L4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TIMM13Q9Y5L4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TIMM13Q9Y5L4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TIMM13Q9Y5L4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TIMM13Q9Y5L4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms