Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms