Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFMBT1Q9UHJ3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms