Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms