Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC17A6Q9P2U8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms