Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms