Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MMP26Q9NRE1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms