Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB9BQ9NP90 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB9BQ9NP90 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms