Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms