Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C11orf49Q9H6J7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C11orf49Q9H6J7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms