Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE41Q9C0J9 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms