Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCGF6Q9BYE7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms