Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCAPERQ9BY12 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms