Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms