Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIOK2Q9BVS4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms