Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP58Q9BVL2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms