Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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