Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms