Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERPUD2Q9BSE4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms