Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA3CQ99985 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms