Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SIN3AQ96ST3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIN3AQ96ST3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms