Protein–RNA interactions for Protein: Q96P65

QRFPR, Pyroglutamylated RFamide peptide receptor, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QRFPRQ96P65 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
QRFPRQ96P65 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
QRFPRQ96P65 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms