Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NSMCE2Q96MF7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NSMCE2Q96MF7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms