Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD3Q96L08 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD3Q96L08 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms