Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNFT2Q96EX2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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