Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms