Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SRSF12Q8WXF0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SRSF12Q8WXF0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms