Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHTF18Q8WVB6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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