Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms