Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms