Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms