Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RYBPQ8N488 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms