Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CLIP4Q8N3C7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CLIP4Q8N3C7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CLIP4Q8N3C7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CLIP4Q8N3C7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CLIP4Q8N3C7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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