Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms