Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKAP1Q86WV1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms