Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00523Q86TU6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms