Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms