Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms