Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms