Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAF7Q6Q0C0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms