Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LETMD1Q6P1Q0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LETMD1Q6P1Q0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms