Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms