Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms